论文查重检测主要是针对学术论文的原创性进行检测，通过比对已有文献库中的内容，发现是否存在抄袭行为。而学术搜索引擎则是为学术研究者提供检索服务，帮助他们找到相关的学术资料和文献。两者的功能定位和使用目的有所不同。

此外，论文查重检测通常采用文本比对算法，如SimHash、Winnowing等，以确保检测结果的准确性和可靠性；而学术搜索引擎则更注重对文献信息的整合和检索效率，常采用PageRank等算法进行排序，以提供用户更优质的检索体验。因此，虽然二者都与学术领域相关，但其功能、应用和技术手段上存在明显差异。